Program Pendidikan di Pesantren Al-Ma'tuq adalah jenjang Mutawassith (Setingkat SMP) untuk ikhwan/putra Markaz Al-Ma'tuq, akhwat/putri Markaz Al-Zamil dan tahfizh putri Markaz Al-'Afaf yang dilanjutkan ke jenjang Tsanawi (setingkat SMA) ikhwan dan akhwat di dalam Pesantren.
Lulusan Pesantren Al-Ma'tuq disamping memperoleh ijazah Pesantren juga mendapatakan ijazah Negara.
Pada tahun 2017, jenjang Tsanawi (setingkat SMA) mendapatkan Mu'adalah (akreditasi) dari univerisitas Islam Madinah Kerajaan Saudi Arabia (KSA).
VISI DAN MISI
VISI: Pesantren yang menyelenggarakan pendidikan Islam secara optimal,
pada tingkat menengah, untuk melahirkan generasi yang unggul
dalam aqidah, ibadah, dan akhlak secara integral, memiliki wawasan internasional, dan mampu menghadapi tantangan global.
MISI:
Menyelenggarakan pendidikan tigkat menengah yang berkualitas dengan metode dan sarana yang selalu mengikuti perkembangan zaman.
Menanamkan akidah ahlussunnah dengan pemahaman Salafusshalih pada anak sesuai masa perkembangan intelektualitasnya.
Membina ibadah yang benar dan akhlak yang mulia.
Menyelenggarakan program tahfizh Al-Quran 30 juz yang berkualitas dan unggul.
Menanamkan cinta kepada Al-Quran, sunnah, Bahasa Arab, dan ilmu-ilmu syar’i.
Menanamkan kecintaan terhadap Negara Kesatuan Republik Indonesia (NKRI)
Membangkitkan semangat dakwah untuk memperbaiki kondisi umat islam.
Mengajarkan ilmu-ilmu umum dan Bahasa Inggris sebagai wasilah untuk dakwah.
Membekali peserta didik dengan keterampilan hidup agar mampu mendiri dan siap menghadapi tantangan zaman.
KOMPENTENSI LULUSAN
HAFALAN
Hafizh Qur’an 30 juz.
AQIDAH
Memahami aqidah Ahlussunnah wal jama’ah sesuai dengan pemahaman Salafusshalih.
ILMU SYAR'I
Memahami ilmu-ilmu syar’i sesuai dengan pemahaman Salafusshalih.
KOMUNIKASI
Mampu berkomunikasi dengan Bahasa Arab dan Inggris dengan baik.
PIDATO
Mampu berpidato dengan Bahasa Indonesia, Arab dan Inggris.